RBPWorld - a comprehensive database of RNA Binding Proteins

RBP Type	N.A.
Diseases
Drug
Main interacting RNAs
Moonlighting functions
Localizations
BulkPerturb-seq

Description

Ensembl ID	MGP_PahariEiJ_G0018784	Gene ID		Accession	-
Symbol		Alias	-	Full Name	NA
Status	Confidence	Length	46653 bases	Strand	Minus strand
Position	15 : 20134037 - 20180689	RNA binding domain	CID
Summary	N.A.

RNA binding domains (RBDs)

Protein	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number
MGP_PahariEiJ_P0038790	CID	PF04818	2.5e-27	1

RNA binding proteomes (RBPomes)

Pubmed ID	Full Name	Cell	Author	Time	Doi

Literatures on RNA binding capacity

Pubmed ID	Title	Author	Time	Journal

Transcripts

Name	Transcript ID	bp	Protein	Translation ID
-	MGP_PahariEiJ_T0038790	3816	243aa	MGP_PahariEiJ_P0038790"/note="transcript_id=MGP_PahariEiJ_T0038790

Gene Model

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Pathways

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Phenotypes

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GWAS

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Source				Target
Ensembl ID	Species	Protein ID	Perc_pos	Perc_id	Species	Protein ID	Perc_pos	Perc_id
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MGP_PahariEiJ_G0018784	mus_pahari	MGP_PahariEiJ_P0070200	6.63984	3.55466	mus_pahari	MGP_PahariEiJ_P0038790	32.0388	17.1521

Orthologs

Ensembl ID	Source				Target
Ensembl ID	Species	Protein ID	Perc_pos	Perc_id	Species	Protein ID	Perc_pos	Perc_id
MGP_PahariEiJ_G0018784	mus_pahari	MGP_PahariEiJ_P0038790	44.9838	37.2168	mus_musculus	ENSMUSP00000043618	44.5513	36.859
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MGP_PahariEiJ_G0018784	mus_pahari	MGP_PahariEiJ_P0038790	44.9838	37.2168	rattus_norvegicus	ENSRNOP00000021624	44.5513	36.859
MGP_PahariEiJ_G0018784	mus_pahari	MGP_PahariEiJ_P0038790	44.9838	37.2168	mus_spicilegus	ENSMSIP00000026150	33.494	27.7108
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