| RBP Type |
N.A. |
| Diseases |
|
| Drug |
|
| Main interacting RNAs |
|
| Moonlighting functions |
|
| Localizations |
|
|
BulkPerturb-seq
|
|
| Ensembl ID | MGP_CASTEiJ_G0017596 | Gene ID |
|
Accession |
- |
| Symbol |
Cdkl3 |
Alias |
- |
Full Name |
cyclin-dependent kinase-like 3 |
| Status |
Confidence |
Length |
93695 bases |
Strand |
Plus strand |
| Position |
11 : 50935115 - 51028809 |
RNA binding domain |
RIO1 |
| Summary |
N.A. |
RNA binding domains (RBDs)
| Protein |
Domain |
Pfam ID |
E-value |
Domain number |
| MGP_CASTEiJ_P0028401 |
RIO1 |
PF01163 |
4.5e-05 |
1 |
RNA binding proteomes (RBPomes)
| Pubmed ID |
Full Name |
Cell |
Author |
Time |
Doi |
Literatures on RNA binding capacity
| Pubmed ID |
Title |
Author |
Time |
Journal |
| Name |
Transcript ID |
bp |
Protein |
Translation ID |
| Cdkl3-001 |
MGP_CASTEiJ_T0028394 |
2765 |
595aa |
MGP_CASTEiJ_P0028394"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028394 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028395 |
2051 |
581aa |
MGP_CASTEiJ_P0028395"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028395 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028396 |
2063 |
585aa |
MGP_CASTEiJ_P0028396"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028396 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028397 |
2387 |
585aa |
MGP_CASTEiJ_P0028397"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028397 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028398 |
2749 |
610aa |
MGP_CASTEiJ_P0028398"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028398 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028399 |
2217 |
457aa |
MGP_CASTEiJ_P0028399"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028399 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028400 |
2008 |
581aa |
MGP_CASTEiJ_P0028400"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028400 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028401 |
665 |
192aa |
MGP_CASTEiJ_P0028401"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028401 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028402 |
2773 |
591aa |
MGP_CASTEiJ_P0028402"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028402 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028403 |
1989 |
579aa |
MGP_CASTEiJ_P0028403"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028403 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028404 |
2770 |
610aa |
MGP_CASTEiJ_P0028404"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028404 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028405 |
1564 |
224aa |
MGP_CASTEiJ_P0028405"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028405 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028406 |
513 |
137aa |
MGP_CASTEiJ_P0028406"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028406 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028407 |
631 |
97aa |
MGP_CASTEiJ_P0028407"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028407 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028408 |
489 |
79aa |
MGP_CASTEiJ_P0028408"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028408 |
| - |
MGP_CASTEiJ_T0028409 |
467 |
91aa |
MGP_CASTEiJ_P0028409"/note="transcript_id=MGP_CASTEiJ_T0028409 |
| Pathway ID |
Pathway Name |
Source |
| | |
| ensgID |
Trait |
pValue |
Pubmed ID |
| ensgID | SNP | Chromosome | Position |
Trait | PubmedID | Or or BEAT |
EFO ID |
|---|
Protein-Protein Interaction (PPI)
| Ensembl ID |
Source |
Target |
| Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0072793 | 58.0986 | 41.7254 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 54.0984 | 38.8525 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0098133 | 32.7083 | 19.2708 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 51.4754 | 30.3279 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0095947 | 33.2661 | 20.7661 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 27.0492 | 16.8852 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0054051 | 42.9735 | 25.4582 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 34.5902 | 20.4918 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0026889 | 44.7977 | 28.9017 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 25.4098 | 16.3934 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0070613 | 54.7945 | 34.589 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 26.2295 | 16.5574 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0091015 | 45.2297 | 28.6219 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 20.9836 | 13.2787 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0035997 | 15.9392 | 8.86243 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 39.5082 | 21.9672 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0037691 | 48.8439 | 30.0578 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 27.7049 | 17.0492 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0019332 | 37.4429 | 23.9726 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 26.8852 | 17.2131 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0048428 | 65.4971 | 44.152 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 36.7213 | 24.7541 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0031635 | 15.903 | 8.82749 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 38.6885 | 21.4754 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0069952 | 21.9388 | 12.6276 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 28.1967 | 16.2295 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0011469 | 16.129 | 5.16129 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 8.19672 | 2.62295 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0024892 | 53.5354 | 35.0168 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 26.0656 | 17.0492 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0026207 | 32.5048 | 18.9293 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 27.8689 | 16.2295 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0034621 | 64.2045 | 44.0341 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 37.0492 | 25.4098 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0070215 | 34.7548 | 21.9616 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 26.7213 | 16.8852 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0036372 | 13.9027 | 8.2423 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 22.9508 | 13.6066 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0024306 | 35.7285 | 21.7565 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 29.3443 | 17.8689 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0021318 | 37.0288 | 22.6164 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 27.377 | 16.7213 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0037089 | 50 | 30.0578 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 28.3607 | 17.0492 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0070128 | 48.773 | 30.9816 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 26.0656 | 16.5574 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0076060 | 38.5776 | 22.8448 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 29.3443 | 17.377 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0026663 | 46.5347 | 30.363 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 23.1148 | 15.082 |
| Ensembl ID |
Source |
Target |
| Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 100 | 100 | mus_musculus_129s1svimj | MGP_129S1SvImJ_P0028987 | 100 | 100 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 97.8689 | 96.5574 | mus_caroli | MGP_CAROLIEiJ_P0026571 | 93.5737 | 92.3197 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 100 | 100 | mus_musculus_aj | MGP_AJ_P0028955 | 100 | 100 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 100 | 100 | mus_musculus_balbcj | MGP_BALBcJ_P0028937 | 100 | 100 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 100 | 100 | mus_musculus_dba2j | MGP_DBA2J_P0028796 | 100 | 100 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 98.5246 | 98.1967 | mus_musculus_c57bl6nj | MGP_C57BL6NJ_P0029430 | 98.3633 | 98.036 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 98.5246 | 98.1967 | mus_musculus_fvbnj | MGP_FVBNJ_P0028767 | 98.3633 | 98.036 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 100 | 100 | mus_musculus_c3hhej | MGP_C3HHeJ_P0028737 | 100 | 100 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 100 | 100 | mus_musculus_lpj | MGP_LPJ_P0028897 | 100 | 100 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 98.5246 | 98.1967 | mus_musculus_nodshiltj | MGP_NODShiLtJ_P0028754 | 98.3633 | 98.036 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 98.5246 | 98.1967 | mus_musculus_cbaj | MGP_CBAJ_P0028660 | 98.3633 | 98.036 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 100 | 100 | mus_musculus | ENSMUSP00000113303 | 100 | 100 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 100 | 100 | mus_musculus_nzohlltj | MGP_NZOHlLtJ_P0029471 | 100 | 100 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 99.8361 | 99.8361 | mus_musculus_pwkphj | MGP_PWKPhJ_P0028107 | 99.8361 | 99.8361 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 97.3771 | 95.5738 | mus_pahari | MGP_PahariEiJ_P0033342 | 93.1034 | 91.3793 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 100 | 100 | mus_musculus_akrj | MGP_AKRJ_P0028924 | 100 | 100 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 99.8361 | 99.1803 | mus_spretus | MGP_SPRETEiJ_P0027942 | 99.8361 | 99.1803 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 95.4098 | 92.6229 | rattus_norvegicus | ENSRNOP00000091215 | 91.7981 | 89.1167 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 94.7541 | 93.4426 | mus_spicilegus | ENSMSIP00000026243 | 95.3795 | 94.0594 |
| MGP_CASTEiJ_G0017596 | mus_musculus_casteij | MGP_CASTEiJ_P0028404 | 100 | 100 | mus_musculus_wsbeij | MGP_WSBEiJ_P0028226 | 100 | 100 |
| Go ID |
Go term |
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