RBPWorld - a comprehensive database of RNA Binding Proteins

RBP Type	N.A.
Diseases
Drug
Main interacting RNAs
Moonlighting functions
Localizations
BulkPerturb-seq

Description

Ensembl ID	MGP_CAROLIEiJ_G0021549	Gene ID		Accession	-
Symbol	Rpp21	Alias	-	Full Name	ribonuclease P 21 subunit
Status	Confidence	Length	2397 bases	Strand	Minus strand
Position	17 : 33329760 - 33332156	RNA binding domain	Rpr2
Summary	N.A.

RNA binding domains (RBDs)

Protein	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number
MGP_CAROLIEiJ_P0044672	Rpr2	PF04032	2.5e-20	1
MGP_CAROLIEiJ_P0044674	Rpr2	PF04032	2.5e-07	1

RNA binding proteomes (RBPomes)

Pubmed ID	Full Name	Cell	Author	Time	Doi

Literatures on RNA binding capacity

Pubmed ID	Title	Author	Time	Journal

Transcripts

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Rpp21-204	MGP_CAROLIEiJ_T0044673	548	No protein	-
Rpp21-205	MGP_CAROLIEiJ_T0044674	330	51aa	MGP_CAROLIEiJ_P0044674"/note="transcript_id=MGP_CAROLIEiJ_T0044674
Rpp21-206	MGP_CAROLIEiJ_T0044675	464	No protein	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source

Phenotypes

ensgID	Trait	pValue	Pubmed ID

GWAS

ensgID	SNP	Chromosome	Position	Trait	PubmedID	Or or BEAT	EFO ID

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Source				Target
Ensembl ID	Species	Protein ID	Perc_pos	Perc_id	Species	Protein ID	Perc_pos	Perc_id
MGP_CAROLIEiJ_G0021549

Orthologs

Ensembl ID	Source				Target
Ensembl ID	Species	Protein ID	Perc_pos	Perc_id	Species	Protein ID	Perc_pos	Perc_id
MGP_CAROLIEiJ_G0021549	mus_caroli	MGP_CAROLIEiJ_P0044672	99.3333	98	mus_musculus	ENSMUSP00000025319	99.3333	98
MGP_CAROLIEiJ_G0021549	mus_caroli	MGP_CAROLIEiJ_P0044672	99.3333	98	mus_spretus	MGP_SPRETEiJ_P0046566	99.3333	98
MGP_CAROLIEiJ_G0021549	mus_caroli	MGP_CAROLIEiJ_P0044672	97.3333	96	mus_pahari	MGP_PahariEiJ_P0044201	97.3333	96
MGP_CAROLIEiJ_G0021549	mus_caroli	MGP_CAROLIEiJ_P0044672	75.3333	70.6667	sarcophilus_harrisii	ENSSHAP00000027681	88.9764	83.4646
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