Description

Ensembl ID Csa17g010150 Gene ID Accession -
Symbol Alias - Full Name NA
Status Confidence Length 15408 bases Strand Minus strand
Position 17 : 2668106 - 2683513 RNA binding domain PPR_3 , AARP2CN , PPR_long , PPR
Summary N.A.

RNA binding domains (RBDs)

Protein Domain Pfam ID E-value Domain number
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 1
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 2
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 3
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 4
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 5
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 6
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 7
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 8
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 9
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 10
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 11
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 12
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 6.5e-106 13
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 14
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 15
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 16
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 17
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 18
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 19
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 20
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 21
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 22
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 23
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 24
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 25
Csa17g010150 PPR_3 PF13812 3.5e-102 26
Csa17g010150 AARP2CN PF08142 1e-27 27
Csa17g010150 PPR_long PF17177 9.2e-59 28
Csa17g010150 PPR_long PF17177 9.2e-59 29
Csa17g010150 PPR_long PF17177 1.7e-56 30
Csa17g010150 PPR_long PF17177 1.7e-56 31
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 32
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 33
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 34
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 35
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 36
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 37
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 38
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 39
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 40
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 41
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 42
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 43
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 44
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 45
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 46
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 47
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 48
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 49
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 50
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 51
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 52
Csa17g010150 PPR PF01535 5.1e-137 53
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 54
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 55
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 56
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 57
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 58
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 59
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 60
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 61
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 62
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 63
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 64
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 65
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 66
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 67
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 68
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 69
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 70
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 71
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 72
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 73
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 74
Csa17g010150 PPR PF01535 1.4e-130 75

RNA binding proteomes (RBPomes)

Pubmed ID Full Name Cell Author Time Doi

Literatures on RNA binding capacity

Pubmed ID Title Author Time Journal

Transcripts

Name Transcript ID bp Protein Translation ID
- Csa17g010150.1 8378 2791aa Csa17g010150.1
- Csa17g010150.2 8798 1641aa Csa17g010150.2

Gene Model

Pathways

Pathway ID Pathway Name Source

Phenotypes

ensgID Trait pValue Pubmed ID

GWAS

ensgIDSNPChromosomePosition TraitPubmedIDOr or BEAT EFO ID

Protein-Protein Interaction (PPI)

Paralogs

Ensembl ID Source Target
Species Protein ID Perc_pos Perc_id Species Protein ID Perc_pos Perc_id
Csa17g010150

Orthologs

Ensembl ID Source Target
Species Protein ID Perc_pos Perc_id Species Protein ID Perc_pos Perc_id
Csa17g010150

Gene Ontology

Go ID Go term No. evidence Entries Species Category

Expression