| RBP Type |
N.A. |
| Diseases |
|
| Drug |
|
| Main interacting RNAs |
|
| Moonlighting functions |
|
| Localizations |
|
|
BulkPerturb-seq
|
|
| Ensembl ID | Aco029810.1.path1 | Gene ID |
|
Accession |
- |
| Symbol |
|
Alias |
- |
Full Name |
|
| Status |
Confidence |
Length |
|
Strand |
|
| Position |
|
RNA binding domain |
Met_10 |
| Summary |
N.A. |
RNA binding domains (RBDs)
| Protein |
Domain |
Pfam ID |
E-value |
Domain number |
RNA binding proteomes (RBPomes)
| Pubmed ID |
Full Name |
Cell |
Author |
Time |
Doi |
Literatures on RNA binding capacity
| Pubmed ID |
Title |
Author |
Time |
Journal |
| Name |
Transcript ID |
bp |
Protein |
Translation ID |
| - |
Aco029810.1.mrna1 |
699 |
179aa |
Aco029810.1.mrna1 |
| Pathway ID |
Pathway Name |
Source |
| | |
| ensgID |
Trait |
pValue |
Pubmed ID |
| ensgID | SNP | Chromosome | Position |
Trait | PubmedID | Or or BEAT |
EFO ID |
|---|
Protein-Protein Interaction (PPI)
| Ensembl ID |
Source |
Target |
| Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco010506.1.mrna1 | 16.9027 | 16.9027 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 100 | 100 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco008049.1.mrna1 | 12.6812 | 6.52174 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 39.1061 | 20.1117 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco014424.1.mrna1 | 11.7264 | 5.70033 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 40.2235 | 19.5531 |
| Ensembl ID |
Source |
Target |
| Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 34.6369 | 22.3464 | chondrus_crispus | CDF32206 | 13.9013 | 8.96861 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 78.2123 | 64.8045 | marchantia_polymorpha | PTQ29667 | 12.939 | 10.7209 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 75.9777 | 64.2458 | physcomitrium_patens | Pp3c9_15020V3.2 | 12.0248 | 10.168 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.3575 | 70.3911 | beta_vulgaris | KMT04175 | 14.7894 | 12.3408 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 83.7989 | 70.9497 | theobroma_cacao | EOY28694 | 14.313 | 12.1183 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 83.2402 | 71.5084 | papaver_somniferum | RZC65651 | 14.2584 | 12.2488 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.9162 | 71.5084 | papaver_somniferum | RZC46330 | 14.1791 | 11.9403 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 85.4749 | 72.067 | cannabis_sativa_female | cds.evm.model.02.2997 | 14.6272 | 12.3327 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 72.6257 | 60.8939 | cucumis_melo | MELO3C007389.2.1 | 12.6459 | 10.6031 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.3575 | 72.6257 | citrullus_lanatus | Cla97C01G021630.1 | 14.4359 | 12.4283 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 83.2402 | 72.6257 | cucumis_sativus | KGN49113 | 13.472 | 11.7541 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.9162 | 67.0391 | arabidopsis_thaliana | AT4G04670.1 | 15.2764 | 12.0603 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 83.7989 | 68.7151 | populus_trichocarpa | Potri.004G015200.4.v4.1 | 14.5349 | 11.9186 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 83.7989 | 65.9218 | brassica_napus | CDX90875 | 14.8662 | 11.6947 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 83.7989 | 65.9218 | brassica_napus | CDY21313 | 15.121 | 11.8952 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.0335 | 72.6257 | malus_domestica_golden | mRNA:MD10G0273600 | 14.966 | 12.6336 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.9162 | 70.9497 | prunus_dulcis | VVA21598 | 14.6577 | 12.2469 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 85.4749 | 74.3017 | cajanus_cajan | C.cajan_04424.t | 14.2458 | 12.3836 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 87.7095 | 73.743 | glycine_max | KRH51088 | 14.6047 | 12.2791 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.0335 | 73.743 | phaseolus_vulgaris | ESW25941 | 14.6249 | 12.5356 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 87.1508 | 72.067 | medicago_truncatula | AES92631 | 14.914 | 12.3327 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 87.1508 | 74.3017 | pisum_sativum | Psat4g006680.2.cds | 14.8289 | 12.6426 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.9162 | 70.9497 | prunus_persica | ONI09963 | 14.6577 | 12.2469 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 0 | 0 | vigna_angularis | KOM33807 | 0 | 0 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 85.4749 | 74.3017 | vigna_unguiculata | Vigun03g446700.1.v1.2 | 14.7115 | 12.7885 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.5922 | 72.6257 | manihot_esculenta | OAY25926 | 20.1299 | 16.8831 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 85.4749 | 72.6257 | solanum_lycopersicum | Solyc05g055610.3.1 | 14.7399 | 12.5241 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 73.1844 | 60.8939 | sesamum_indicum | SIN_1006999.t | 12.5119 | 10.4107 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.9162 | 73.743 | solanum_tuberosum | PGSC0003DMT400060067 | 20.3481 | 17.6707 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.3575 | 71.5084 | helianthus_annuus | mRNA:HanXRQr2_Chr05g0193431 | 19.6871 | 16.6884 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 3.35196 | 2.23464 | helianthus_annuus | CDS:HanXRQr2_Chr05g0193441.1 | 2.12766 | 1.41844 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.3575 | 71.5084 | helianthus_annuus | mRNA:HanXRQr2_Chr05g0193451 | 15.1 | 12.8 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.3575 | 71.5084 | lactuca_sativa | cds-PLY66853.1 | 14.9505 | 12.6733 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 82.6816 | 70.3911 | capsicum_annuum | PHT82546 | 14.439 | 12.2927 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.0335 | 76.5363 | avena_sativa_ot3098 | cds.AVESA.00001b.r3.2Ag0000109.3 | 14 | 12.4545 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.5922 | 76.5363 | avena_sativa_ot3098 | cds.AVESA.00001b.r3.2Cg0000704.2 | 14.0781 | 12.4432 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.0335 | 76.5363 | avena_sativa_ot3098 | cds.AVESA.00001b.r3.2Dg0002672.5 | 14 | 12.4545 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.5922 | 76.5363 | avena_sativa_sang | AVESA.00010b.r2.2CG0275550.1.CDS | 14.2594 | 12.6035 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.0335 | 76.5363 | avena_sativa_sang | AVESA.00010b.r2.2AG0198480.1.CDS | 16.9045 | 15.0384 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.0335 | 76.5363 | avena_sativa_sang | AVESA.00010b.r2.2DG0350260.1.CDS | 14.1805 | 12.6151 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 88.8268 | 77.095 | oryza_longistaminata | KN539000.1_FGP002 | 13.7069 | 11.8966 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 88.8268 | 75.9777 | oryza_brachyantha | OB07G21940.1 | 15.2008 | 13.0019 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 88.8268 | 77.095 | oryza_glaberrima | ORGLA07G0134000.1 | 15.2445 | 13.2311 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 89.3855 | 77.095 | oryza_nivara | ONIVA07G14410.2 | 15.1515 | 13.0682 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 73.743 | 64.8045 | lolium_perenne | cds.KYUSt_chr2.19535 | 13.2663 | 11.6583 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 88.2682 | 77.095 | oryza_punctata | OPUNC07G14870.1 | 15.019 | 13.1179 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 87.7095 | 79.3296 | secale_cereale | SECCE2Rv1G0090130.1 | 14.4434 | 13.0635 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 88.8268 | 77.095 | oryza_rufipogon | ORUFI07G16640.1 | 14.9859 | 13.0066 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 55.8659 | 51.3966 | setaria_italica | KQL25990 | 9.84252 | 9.05512 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 88.8268 | 77.6536 | setaria_viridis | TKW34983 | 14.695 | 12.8466 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 87.7095 | 79.3296 | triticum_turgidum | TRITD2Av1G090090.3 | 14.3379 | 12.968 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 87.7095 | 78.771 | triticum_turgidum | TRITD2Bv1G093910.2 | 14.3379 | 12.8767 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 87.7095 | 78.771 | triticum_aestivum | TraesCS2B02G248800.1 | 14.4434 | 12.9715 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 87.7095 | 79.3296 | triticum_aestivum | TraesCS2D02G229200.1 | 14.4434 | 13.0635 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.5922 | 78.2123 | triticum_aestivum | TraesCS2A02G223200.1 | 14.2594 | 12.8795 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 49.162 | 39.1061 | trifolium_pratense | Tp57577_TGAC_v2_mRNA21020 | 72.7273 | 57.8512 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 85.4749 | 74.3017 | vitis_vinifera | Vitvi10g00098_P001 | 14.6833 | 12.7639 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 85.4749 | 72.6257 | amborella_trichopoda | ERN17346 | 13.759 | 11.6906 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 88.8268 | 77.6536 | sorghum_bicolor | KXG36320 | 14.7086 | 12.8585 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 85.4749 | 73.1844 | coffea_canephora | CDP04399 | 14.5161 | 12.4288 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 85.4749 | 73.1844 | juglans_regia | cds.Jr03_11170_p1 | 14.6411 | 12.5359 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 70.9497 | 56.4246 | ostreococcus_lucimarinus | ABO97856 | 45.6835 | 36.3309 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 89.9441 | 76.5363 | dioscorea_rotundata | DRNTG_24732.1 | 14.9489 | 12.7205 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.0335 | 69.8324 | pistacia_vera | cds-EVM0008130.1 | 14.9515 | 12.1359 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 0 | 0 | nicotiana_attenuata | OIT26386 | 0 | 0 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 88.8268 | 77.095 | oryza_meridionalis | OMERI07G12920.1 | 15.0426 | 13.0558 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 88.8268 | 77.095 | oryza_glumipatula | OGLUM07G15900.1 | 14.8183 | 12.8611 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 88.2682 | 76.5363 | saccharum_spontaneum | Sspon.02G0048090-1C-mRNA-1:cds | 14.5488 | 12.6151 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.0335 | 70.9497 | quercus_lobata | QL05p073195:mrna | 15.0097 | 12.3782 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 80.4469 | 69.8324 | cynara_cardunculus | KVH89619 | 15.3029 | 13.2837 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.9162 | 67.0391 | arabidopsis_lyrata | fgenesh2_kg.6__3241__AT4G04670.1 | 15.261 | 12.0482 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.3575 | 65.9218 | arabidopsis_halleri | g21428.t1 | 12.0032 | 9.37997 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.9162 | 68.1564 | eutrema_salsugineum | ESQ38129 | 15.0943 | 12.1152 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 83.2402 | 73.1844 | olea_europaea | OE9A026264C1 | 14.0301 | 12.3352 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 86.0335 | 73.743 | ipomoea_triloba | itb02g03750.t2 | 14.4601 | 12.3944 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 89.3855 | 77.095 | oryza_indica | BGIOSGA025799-PA | 14.7738 | 12.7424 |
| Aco029810.1.path1 | ananas_comosus | Aco029810.1.mrna1 | 84.3575 | 73.1844 | corymbia_citriodora | cds-KAF8030133.1 | 14.3264 | 12.4288 |
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