| RBP Type |
N.A. |
| Diseases |
|
| Drug |
|
| Main interacting RNAs |
|
| Moonlighting functions |
|
| Localizations |
|
|
BulkPerturb-seq
|
|
| Ensembl ID | Aco017223.1.path1 | Gene ID |
|
Accession |
- |
| Symbol |
|
Alias |
- |
Full Name |
|
| Status |
Confidence |
Length |
|
Strand |
|
| Position |
|
RNA binding domain |
PTS_2-RNA |
| Summary |
N.A. |
RNA binding domains (RBDs)
| Protein |
Domain |
Pfam ID |
E-value |
Domain number |
RNA binding proteomes (RBPomes)
| Pubmed ID |
Full Name |
Cell |
Author |
Time |
Doi |
Literatures on RNA binding capacity
| Pubmed ID |
Title |
Author |
Time |
Journal |
| Name |
Transcript ID |
bp |
Protein |
Translation ID |
| - |
Aco017223.1.mrna1 |
1020 |
339aa |
Aco017223.1.mrna1 |
| Pathway ID |
Pathway Name |
Source |
| | |
| ensgID |
Trait |
pValue |
Pubmed ID |
| ensgID | SNP | Chromosome | Position |
Trait | PubmedID | Or or BEAT |
EFO ID |
|---|
Protein-Protein Interaction (PPI)
| Ensembl ID |
Source |
Target |
| Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
| Aco017223.1.path1 | | | | | | | | |
| Ensembl ID |
Source |
Target |
| Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 31.5634 | 18.5841 | chlamydomonas_reinhardtii | PNW85575 | 44.5833 | 26.25 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 56.9322 | 42.1829 | marchantia_polymorpha | PTQ32002 | 36.8321 | 27.2901 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 54.5723 | 41.5929 | physcomitrium_patens | Pp3c9_2940V3.5 | 50.4087 | 38.4196 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 58.9971 | 47.1976 | beta_vulgaris | KMT00082 | 76.9231 | 61.5385 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.6667 | 56.0472 | ficus_carica | FCD_00024890-RA:cds | 73.3766 | 61.6883 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 70.5015 | 58.7021 | theobroma_cacao | EOX96231 | 81.2925 | 67.6871 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 69.3215 | 53.3923 | papaver_somniferum | RZC57852 | 69.7329 | 53.7092 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 57.8171 | 46.0177 | papaver_somniferum | RZC73297 | 65.1163 | 51.8272 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 68.1416 | 51.0324 | cannabis_sativa_female | cds.evm.model.09.1459 | 52.027 | 38.964 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 69.9115 | 55.7522 | cucumis_melo | MELO3C006196.2.1 | 80.8874 | 64.5051 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 69.0266 | 55.1622 | cucumis_sativus | KGN56605 | 79.8635 | 63.8225 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 63.1268 | 49.2625 | arabidopsis_thaliana | AT2G45330.1 | 74.0484 | 57.7855 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 52.8024 | 41.2979 | arabidopsis_thaliana | AT5G23600.1 | 84.434 | 66.0377 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.6667 | 52.5074 | populus_trichocarpa | Potri.013G094500.1.v4.1 | 77.6632 | 61.1684 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.0767 | 52.5074 | populus_trichocarpa | Potri.002G117000.1.v4.1 | 76.9759 | 61.1684 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 31.2684 | 25.3687 | brassica_napus | CDX74724 | 80.916 | 65.6489 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 50.7375 | 38.0531 | brassica_napus | CDX74729 | 39.5402 | 29.6552 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 35.1032 | 26.5487 | brassica_napus | CDY51814 | 68.7861 | 52.0231 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 61.6519 | 50.7375 | brassica_napus | CDX74721 | 80.0766 | 65.9004 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 19.469 | 14.7493 | brassica_napus | CDY37033 | 82.5 | 62.5 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.7817 | 53.3923 | brassica_napus | CDY18935 | 59.9462 | 48.6559 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 64.6018 | 52.5074 | brassica_napus | CDX74727 | 61.6901 | 50.1408 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 61.9469 | 49.5575 | malus_domestica_golden | mRNA:MD07G0098700 | 82.0312 | 65.625 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.1917 | 53.3923 | brassica_juncea | cds.BjuA05g04510S | 31.1268 | 25.493 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.3717 | 53.9823 | prunus_dulcis | VVA24972 | 67.9758 | 55.287 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.9617 | 52.8024 | cajanus_cajan | C.cajan_18532.t | 76.431 | 60.2694 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 63.4218 | 50.1475 | glycine_max | KRH04971 | 63.9881 | 50.5952 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 58.9971 | 42.4779 | glycine_max | KRH05888 | 65.1466 | 46.9055 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 25.3687 | 21.2389 | glycine_max | KRH65268 | 84.3137 | 70.5882 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 34.2183 | 27.4336 | glycine_max | KRH05897 | 82.8571 | 66.4286 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 48.6726 | 37.4631 | lupinus_angustifolius | OIW19007 | 71.7391 | 55.2174 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 67.8466 | 54.5723 | phaseolus_vulgaris | ESW06883 | 78.7671 | 63.3562 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 58.9971 | 47.1976 | medicago_truncatula | KEH30858 | 81.3008 | 65.0406 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.1917 | 53.0973 | medicago_truncatula | AES87263 | 76.4706 | 62.2837 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.1917 | 52.8024 | pisum_sativum | Psat7g231560.1.cds | 73.913 | 59.8662 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.9617 | 54.2773 | prunus_persica | ONI22673 | 77.2109 | 62.585 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 64.0118 | 52.5074 | vigna_radiata | Vradi0281s00040.1 | 80.9701 | 66.4179 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 67.5516 | 53.6873 | vigna_angularis | KOM57693 | 78.4247 | 62.3288 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.9617 | 54.2773 | vigna_unguiculata | Vigun10g112500.2.v1.2 | 64.1243 | 51.9774 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 61.6519 | 50.7375 | vigna_unguiculata | Vigun10g112600.1.v1.2 | 72.5694 | 59.7222 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 67.8466 | 55.1622 | manihot_esculenta | OAY62416 | 77.4411 | 62.963 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 67.5516 | 53.3923 | solanum_lycopersicum | Solyc01g091210.3.1 | 76.3333 | 60.3333 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 68.7316 | 53.0973 | sesamum_indicum | SIN_1003501.t | 78.7162 | 60.8108 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 35.9882 | 28.9086 | sesamum_indicum | SIN_1025092.t | 82.9932 | 66.6667 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 64.6018 | 51.6224 | solanum_tuberosum | PGSC0003DMT400066771 | 83.908 | 67.0498 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.6667 | 53.6873 | lactuca_sativa | cds-PLY79705.1 | 74.0984 | 59.6721 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 54.8673 | 46.9027 | lactuca_sativa | cds-PLY77379.1 | 83.0357 | 70.9821 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.9617 | 53.9823 | lactuca_sativa | cds-PLY77383.1 | 78.5467 | 63.3218 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 67.2566 | 53.0973 | capsicum_annuum | PHT93596 | 75.4967 | 59.6026 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.0767 | 57.8171 | avena_sativa_ot3098 | cds.AVESA.00001b.r3.5Cg0003243.1 | 70.2194 | 61.442 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.3717 | 57.8171 | avena_sativa_sang | AVESA.00010b.r2.5CG0865000.1.CDS | 80.0712 | 69.7509 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.4867 | 57.5221 | avena_sativa_sang | AVESA.00010b.r2.7DG1337320.1.CDS | 79.5699 | 69.8925 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.1917 | 56.9322 | avena_sativa_sang | AVESA.00010b.r2.7AG1201810.1.CDS | 80.3636 | 70.1818 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 51.9174 | 47.1976 | oryza_longistaminata | KN539033.1_FGP011 | 90.7216 | 82.4742 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 62.2419 | 56.9322 | oryza_brachyantha | OB06G12090.1 | 79.9242 | 73.1061 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 64.6018 | 58.1121 | oryza_glaberrima | ORGLA06G0021600.1 | 79.6364 | 71.6364 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.4867 | 58.9971 | oryza_nivara | ONIVA06G02620.1 | 77.6224 | 69.9301 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 52.8024 | 46.6077 | lolium_perenne | cds.KYUSt_chr7.39122 | 92.268 | 81.4433 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 56.0472 | 50.4425 | oryza_punctata | OPUNC06G01980.1 | 77.8689 | 70.082 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.1917 | 56.9322 | secale_cereale | SECCE4Rv1G0272280.1 | 77.5439 | 67.7193 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.4867 | 58.9971 | oryza_rufipogon | ORUFI06G02140.1 | 77.6224 | 69.9301 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 63.4218 | 53.9823 | setaria_italica | KQL09153 | 57.4866 | 48.9305 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 63.4218 | 53.6873 | setaria_viridis | TKW19488 | 57.4866 | 48.6631 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 57.5221 | 48.0826 | triticum_turgidum | TRITD4Av1G243050.1 | 64.5695 | 53.9735 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.1917 | 56.9322 | triticum_turgidum | TRITD7Av1G018760.3 | 78.0919 | 68.1979 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.4867 | 57.2271 | triticum_turgidum | TRITD2Av1G266290.1 | 77.8947 | 68.0702 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.4867 | 57.2271 | triticum_aestivum | TraesCS2A02G485300.1 | 77.8947 | 68.0702 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.9617 | 58.4071 | triticum_aestivum | TraesCS3D02G058800.1 | 78.5467 | 68.5121 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 65.7817 | 57.2271 | triticum_aestivum | TraesCS7D02G066900.1 | 77.972 | 67.8322 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 59.882 | 52.2124 | triticum_aestivum | TraesCS5D02G040300.1 | 81.5261 | 71.0843 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.0767 | 57.8171 | triticum_aestivum | TraesCS4A02G417300.1 | 78.3217 | 68.5315 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.3717 | 52.5074 | trifolium_pratense | Tp57577_TGAC_v2_mRNA10174 | 75.5034 | 59.7315 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 71.3864 | 58.7021 | vitis_vinifera | Vitvi15g01488_P002 | 80.3987 | 66.113 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 67.2566 | 54.5723 | amborella_trichopoda | ERN17530 | 77.2881 | 62.7119 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 67.8466 | 59.587 | sorghum_bicolor | KXG19208 | 78.7671 | 69.1781 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 68.7316 | 56.3422 | coffea_canephora | CDO97696 | 76.3934 | 62.623 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 63.1268 | 54.2773 | asparagus_officinalis | ONK80037 | 89.916 | 77.3109 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 36.5782 | 27.4336 | juglans_regia | cds.Jr03_21700_p1 | 64.5833 | 48.4375 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.6667 | 53.6873 | juglans_regia | cds.Jr03_21690_p1 | 72.9032 | 58.7097 |
| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 66.9617 | 54.8673 | prunus_avium | Pav_sc0000017.1_g100.1.mk:mrna | 77.2109 | 63.2653 |
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| Aco017223.1.path1 | ananas_comosus | Aco017223.1.mrna1 | 70.7965 | 58.1121 | dioscorea_rotundata | DRNTG_20280.2 | 78.6885 | 64.5902 |
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