| RBP Type |
N.A. |
| Diseases |
|
| Drug |
|
| Main interacting RNAs |
|
| Moonlighting functions |
|
| Localizations |
|
|
BulkPerturb-seq
|
|
| Ensembl ID | Aco007023.1.path1 | Gene ID |
|
Accession |
- |
| Symbol |
|
Alias |
- |
Full Name |
|
| Status |
Confidence |
Length |
|
Strand |
|
| Position |
|
RNA binding domain |
RNA_pol_Rpb1_4 , RNA_pol_Rpb1_1 , RNA_pol_Rpb1_5 , RNA_pol_Rpb1_2 , RNA_pol_Rpb1_3 |
| Summary |
N.A. |
RNA binding domains (RBDs)
| Protein |
Domain |
Pfam ID |
E-value |
Domain number |
RNA binding proteomes (RBPomes)
| Pubmed ID |
Full Name |
Cell |
Author |
Time |
Doi |
Literatures on RNA binding capacity
| Pubmed ID |
Title |
Author |
Time |
Journal |
| Name |
Transcript ID |
bp |
Protein |
Translation ID |
| - |
Aco007023.1.mrna1 |
4560 |
1519aa |
Aco007023.1.mrna1 |
| Pathway ID |
Pathway Name |
Source |
| | |
| ensgID |
Trait |
pValue |
Pubmed ID |
| ensgID | SNP | Chromosome | Position |
Trait | PubmedID | Or or BEAT |
EFO ID |
|---|
Protein-Protein Interaction (PPI)
| Ensembl ID |
Source |
Target |
| Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco015559.1.mrna1 | 29.8398 | 16.6222 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 29.4273 | 16.3924 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco009331.1.mrna1 | 41.2621 | 27.7778 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 50.3621 | 33.9039 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco025400.1.mrna1 | 37.4925 | 23.0954 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 41.1455 | 25.3456 |
| Ensembl ID |
Source |
Target |
| Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
Species |
Protein ID |
Perc_pos |
Perc_id |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 37.5905 | 27.3206 | chondrus_crispus | CDF39885 | 42.7076 | 31.0396 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 41.0138 | 32.5214 | chlamydomonas_reinhardtii | PNW84960 | 40.6128 | 32.2034 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 68.6636 | 56.9454 | marchantia_polymorpha | PTQ38383 | 74.3937 | 61.6976 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 10.1382 | 4.67413 | physcomitrium_patens | Pp3c9_17770V3.1 | 40.5263 | 18.6842 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 8.29493 | 4.0158 | physcomitrium_patens | Pp3c5_18590V3.2 | 36.6279 | 17.7326 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 11.7182 | 5.92495 | physcomitrium_patens | Pp3c4_14790V3.1 | 37.6321 | 19.0275 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 10.4674 | 5.46412 | physcomitrium_patens | Pp3c9_12713V3.1 | 39.9497 | 20.8543 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 6.38578 | 3.4233 | physcomitrium_patens | Pp3c17_12280V3.1 | 46.4115 | 24.8804 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 10.1382 | 4.67413 | physcomitrium_patens | Pp3c9_17780V3.1 | 40.5263 | 18.6842 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 4.2133 | 2.43581 | physcomitrium_patens | Pp3c11_17080V3.1 | 29.2237 | 16.895 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 10.1382 | 4.87163 | physcomitrium_patens | PAC:32900562.CDS.1 | 40 | 19.2208 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 5.20079 | 2.89664 | physcomitrium_patens | Pp3c3_29710V3.1 | 43.1694 | 24.0437 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 9.47992 | 5.26662 | physcomitrium_patens | Pp3c25_15150V3.1 | 43.6364 | 24.2424 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 66.1619 | 54.707 | beta_vulgaris | KMS96001 | 74.3343 | 61.4645 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 63.9236 | 53.917 | beta_vulgaris | KMS99616 | 72.247 | 60.9375 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 71.1652 | 59.5128 | ficus_carica | FCD_00002424-RA:cds | 73.0899 | 61.1224 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 68.5978 | 56.682 | ficus_carica | FCD_00002423-RA:cds | 73.796 | 60.9773 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 8.55826 | 7.24161 | theobroma_cacao | EOY34230 | 80.2469 | 67.9012 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 7.8341 | 6.84661 | theobroma_cacao | EOY20713 | 83.8028 | 73.2394 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 10.6649 | 8.88743 | theobroma_cacao | EOY34232 | 80.597 | 67.1642 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 68.0053 | 57.2087 | theobroma_cacao | EOY20721 | 74.0502 | 62.2939 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 31.4022 | 25.6748 | papaver_somniferum | RZC60092 | 73.4977 | 60.0924 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 67.2811 | 56.0237 | papaver_somniferum | RZC60112 | 68.5446 | 57.0758 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 16.129 | 12.7057 | papaver_somniferum | RZC60134 | 65.3333 | 51.4667 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 69.8486 | 58.5253 | papaver_somniferum | RZC83527 | 74.771 | 62.6498 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 24.6873 | 20.0132 | papaver_somniferum | RZC59826 | 69.1882 | 56.0886 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 69.1244 | 58.3937 | cannabis_sativa_female | cds.evm.model.02.2276 | 75 | 63.3571 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 68.2028 | 57.0112 | citrullus_lanatus | Cla97C03G053130.1 | 74 | 61.8571 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 8.55826 | 6.97828 | cucumis_sativus | KGN64726 | 69.5187 | 56.6845 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 8.75576 | 6.91244 | cucumis_sativus | KGN64728 | 64.8781 | 51.2195 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 51.8762 | 43.6471 | cucumis_sativus | KGN64727 | 72.6937 | 61.1624 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 66.1619 | 54.1804 | arabidopsis_thaliana | AT5G60040.2 | 72.2502 | 59.1661 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 67.0836 | 55.0362 | populus_trichocarpa | Potri.001G341900.1.v4.1 | 72.2695 | 59.2908 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 65.4378 | 53.1929 | brassica_napus | CDY09230 | 72.5547 | 58.9781 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 66.8861 | 57.0112 | malus_domestica_golden | mRNA:MD03G0088800 | 73.2516 | 62.4369 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 4.87163 | 3.68664 | malus_domestica_golden | CDS:MD09G0136000.1 | 67.2727 | 50.9091 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 55.0362 | 45.3588 | malus_domestica_golden | CDS:MD09G0136100.1 | 71.453 | 58.8889 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 65.4378 | 53.1929 | brassica_juncea | cds.BjuA02g33360S | 72.5547 | 58.9781 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 64.977 | 52.2054 | brassica_juncea | cds.BjuB05g29510S | 60.073 | 48.2654 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 11.1916 | 8.62409 | prunus_dulcis | VVA28561 | 58.0205 | 44.7099 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 67.6761 | 56.6162 | prunus_dulcis | VVA20814 | 72.1404 | 60.3509 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 6.84661 | 5.59579 | prunus_dulcis | VVA28562 | 74.2857 | 60.7143 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 5.39829 | 4.34496 | prunus_dulcis | VVA28563 | 74.5455 | 60 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 11.8499 | 8.49243 | prunus_dulcis | VVA28564 | 58.2524 | 41.7476 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 64.7795 | 52.7979 | cajanus_cajan | C.cajan_04756.t | 60.6658 | 49.4451 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 8.16327 | 6.71494 | cajanus_cajan | C.cajan_47704.t | 70.0565 | 57.6271 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 67.1494 | 55.102 | glycine_max | KRG88695 | 73.3285 | 60.1725 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 5.72745 | 4.4108 | lupinus_angustifolius | OIV99363 | 71.3115 | 54.918 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 66.0303 | 54.2462 | lupinus_angustifolius | OIV99362 | 72.0546 | 59.1954 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 66.8203 | 53.9829 | phaseolus_vulgaris | ESW04135 | 72.9167 | 58.908 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 64.3186 | 51.6129 | medicago_truncatula | AES88756 | 70.389 | 56.4841 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 64.5161 | 52.3371 | medicago_truncatula | AES88750 | 71.066 | 57.6505 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 64.977 | 53.3246 | pisum_sativum | Psat7g221400.1.cds | 70.9052 | 58.1897 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 67.6103 | 56.5504 | prunus_persica | ONI00446 | 72.0702 | 60.2807 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 6.71494 | 5.46412 | vigna_radiata | Vradi02g07670.1 | 74.4526 | 60.5839 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 64.3845 | 51.6129 | vigna_radiata | Vradi02g05380.1 | 69.8073 | 55.96 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 66.3594 | 53.5221 | vigna_angularis | KOM50756 | 71.7438 | 57.8648 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 15.7999 | 11.3891 | vigna_unguiculata | Vigun07g111600.1.v1.2 | 71.4286 | 51.4881 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 67.0178 | 53.9829 | vigna_unguiculata | Vigun11g149700.1.v1.2 | 73.1322 | 58.908 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 16.129 | 11.5207 | vigna_unguiculata | Vigun07g111500.3.v1.2 | 72.9167 | 52.0833 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 67.6761 | 55.5629 | manihot_esculenta | OAY24253 | 72.8045 | 59.7734 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 68.7294 | 56.7479 | solanum_lycopersicum | Solyc11g072730.2.1 | 75.1079 | 62.0144 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 64.9111 | 53.1929 | sesamum_indicum | SIN_1015650.t | 68.951 | 56.5035 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 3.29164 | 2.69914 | solanum_tuberosum | PGSC0003DMT400065237 | 83.3333 | 68.3333 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 66.4911 | 54.707 | helianthus_annuus | mRNA:HanXRQr2_Chr08g0346311 | 72.5575 | 59.6983 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 67.2153 | 55.9579 | helianthus_annuus | mRNA:HanXRQr2_Chr04g0161381 | 72.9807 | 60.7577 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 66.6886 | 55.9579 | lactuca_sativa | cds-PLY73104.1 | 72.8777 | 61.1511 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 7.96577 | 4.67413 | lactuca_sativa | cds-PLY74806.1 | 34.9711 | 20.5202 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 65.3061 | 53.5221 | lactuca_sativa | cds-PLY74414.1 | 70.8066 | 58.03 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 68.6636 | 56.9454 | capsicum_annuum | PHT62712 | 75.09 | 62.275 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 3.8183 | 3.4233 | capsicum_annuum | PHT94899 | 77.3333 | 69.3333 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 25.2798 | 19.9473 | capsicum_annuum | PHT68847 | 73.7044 | 58.1574 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 9.41409 | 6.12245 | capsicum_annuum | PHT95213 | 53.1599 | 34.5725 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 5.00329 | 4.60829 | capsicum_annuum | PHT95214 | 73.7864 | 67.9612 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 75.2469 | 65.1086 | avena_sativa_ot3098 | cds.AVESA.00001b.r3.7Dg0000754.2 | 82.1121 | 71.0489 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 75.6419 | 65.2403 | avena_sativa_ot3098 | cds.AVESA.00001b.r3.5Cg0000331.1 | 82.5431 | 71.1925 |
| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 47.2679 | 40.2238 | avena_sativa_ot3098 | cds.AVESA.00001b.r3.7Ag0001799.1 | 80.4031 | 68.4211 |
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| Aco007023.1.path1 | ananas_comosus | Aco007023.1.mrna1 | 57.077 | 49.4404 | avena_sativa_ot3098 | cds.AVESA.00001b.r3.6Cg0001460.1 | 76.9299 | 66.6371 |
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