RBPWorld - a comprehensive database of RNA Binding Proteins

RBP Type	N.A.
Diseases
Drug
Main interacting RNAs
Moonlighting functions
Localizations
BulkPerturb-seq

Description

Ensembl ID	AET3Gv20768600	Gene ID		Accession	-
Symbol		Alias	-	Full Name	NA
Status	Confidence	Length	10615 bases	Strand	Plus strand
Position	3D : 452559398 - 452570012	RNA binding domain	PPR_3 , PPR_long , Ribosomal_L24e , PPR
Summary	N.A.

RNA binding domains (RBDs)

Protein	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	3.8e-28	1
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	3.8e-28	2
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	3.8e-28	3
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	3.8e-28	4
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	7e-28	5
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	7e-28	6
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	7e-28	7
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	7e-28	8
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	6.2e-27	9
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	6.2e-27	10
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	6.2e-27	11
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	6.2e-27	12
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	8.4e-27	13
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	8.4e-27	14
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	8.4e-27	15
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	8.4e-27	16
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	8.5e-27	17
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	8.5e-27	18
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	8.5e-27	19
AET3Gv20768600	PPR_3	PF13812	8.5e-27	20
AET3Gv20768600	PPR_long	PF17177	8.2e-18	21
AET3Gv20768600	PPR_long	PF17177	8.4e-18	22
AET3Gv20768600	PPR_long	PF17177	3.7e-17	23
AET3Gv20768600	PPR_long	PF17177	4.8e-17	24
AET3Gv20768600	PPR_long	PF17177	4.9e-17	25
AET3Gv20768600	Ribosomal_L24e	PF01246	2.5e-27	26
AET3Gv20768600	Ribosomal_L24e	PF01246	2.5e-27	27
AET3Gv20768600	Ribosomal_L24e	PF01246	2.5e-27	28
AET3Gv20768600	Ribosomal_L24e	PF01246	6.2e-27	29
AET3Gv20768600	Ribosomal_L24e	PF01246	6.2e-27	30
AET3Gv20768600	Ribosomal_L24e	PF01246	1.9e-26	31
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	1.2e-43	32
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	1.2e-43	33
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	1.2e-43	34
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	1.2e-43	35
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	1.2e-43	36
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	1.2e-43	37
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.6e-43	38
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.6e-43	39
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.6e-43	40
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.6e-43	41
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.6e-43	42
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.6e-43	43
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	2.1e-41	44
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	2.1e-41	45
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	2.1e-41	46
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AET3Gv20768600	PPR	PF01535	2.1e-41	49
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.3e-41	50
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.3e-41	51
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.3e-41	52
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.3e-41	53
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.3e-41	54
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.3e-41	55
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.4e-41	56
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.4e-41	57
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AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.4e-41	59
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.4e-41	60
AET3Gv20768600	PPR	PF01535	3.4e-41	61

RNA binding proteomes (RBPomes)

Pubmed ID	Full Name	Cell	Author	Time	Doi

Literatures on RNA binding capacity

Pubmed ID	Title	Author	Time	Journal

Transcripts

Name	Transcript ID	bp	Protein	Translation ID
-	AET3Gv20768600.11	3720	599aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.10	4204	628aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.4	2050	137aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.13	1845	420aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.3	943	162aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.12	641	213aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.7	896	133aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.14	1523	384aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.9	4713	627aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.8	702	75aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.5	1999	137aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.1	1954	162aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.2	1101	137aa	AET3Gv20768600
-	AET3Gv20768600.6	729	82aa	AET3Gv20768600

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source

Phenotypes

ensgID	Trait	pValue	Pubmed ID

GWAS

ensgID	SNP	Chromosome	Position	Trait	PubmedID	Or or BEAT	EFO ID

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Source				Target
Ensembl ID	Species	Protein ID	Perc_pos	Perc_id	Species	Protein ID	Perc_pos	Perc_id
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET1Gv20429000.1	21.2341	11.4338	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	18.6306	10.0318
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET5Gv20883100.1	22.3048	11.1524	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	19.1083	9.55414
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET3Gv20220700.1	17.0839	8.83652	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	18.4713	9.55414
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET1Gv20712600.1	33.9286	16.9643	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	6.05096	3.02548
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET7Gv20047300.9	25.3937	11.0236	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	20.5414	8.9172
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET2Gv20959600.1	19.6653	8.78661	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	7.48408	3.34395
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET5Gv20700000.3	25.3394	13.1222	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	17.8344	9.23567
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET1Gv20267600.1	34.2105	15.7895	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	10.3503	4.77707
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET2Gv20412500.2	21.875	11.5234	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	17.8344	9.3949
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET7Gv21144500.8	21.6071	11.4286	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	19.2675	10.1911
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET6Gv20596100.4	21.8924	10.9462	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	18.7898	9.3949
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET7Gv20144600.6	20.4885	10.9905	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	24.0446	12.8981
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET2Gv20700900.3	13.7457	6.52921	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	19.1083	9.07643
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET5Gv20189100.1	12.3722	7.25971	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	19.2675	11.3057
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET1Gv20518100.2	18.4862	8.58806	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	20.2229	9.3949
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET5Gv20602200.1	18.7207	9.04836	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	19.1083	9.23567
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET3Gv21225200.1	22.5329	10.8553	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	21.8153	10.5096
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET2Gv20365600.1	19.5021	10.3734	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	14.9682	7.96178
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET3Gv20309700.1	19.5276	10.3937	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	19.7452	10.5096
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET3Gv20529300.1	19.3062	9.95475	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	20.3822	10.5096
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET1Gv20855600.6	13.6439	5.82363	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	13.0573	5.57325
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET7Gv20484200.3	23.3463	10.8949	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	19.1083	8.9172
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET4Gv20693000.1	21.7463	11.5321	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	21.0191	11.1465
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET4Gv20474100.4	18.649	9.10426	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	20.2229	9.87261
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET4Gv20214200.2	18.1818	9.51374	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	13.6943	7.16561
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET4Gv20213900.1	17.9704	9.72516	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	13.535	7.32484
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET1Gv20399300.1	14.8333	7.83333	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	14.172	7.48408
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET3Gv20483900.2	21.9638	11.3695	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	13.535	7.00637
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET5Gv21152400.1	18.8586	9.55335	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	24.2038	12.2611
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET7Gv20985800.1	20.8791	11.146	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	21.1783	11.3057
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET6Gv20777100.4	20.1581	9.68379	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	16.242	7.80255
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET6Gv20752300.12	21.5292	9.45674	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	17.0382	7.48408
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET4Gv20816000.1	20.2353	9.64706	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	13.6943	6.52866
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET2Gv20222000.4	14.0078	7.9118	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	17.1975	9.71338
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET3Gv20502600.4	17.7236	8.29268	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	17.3567	8.12102
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET2Gv20475700.3	19.0349	10.4558	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	22.6115	12.4204
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET2Gv20739900.2	18.1669	9.81997	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	17.6752	9.55414
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET3Gv20807200.3	20.9756	11.7073	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	13.6943	7.64331
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET7Gv20719300.13	17.4479	9.11458	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	21.3376	11.1465
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET4Gv20672700.2	20.7944	10.0467	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	14.172	6.84713
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET5Gv20234300.1	13.2426	7.67327	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	17.0382	9.87261
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET3Gv20648400.5	12.1026	5.53846	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	18.7898	8.59873
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET2Gv21250700.5	14.1921	7.75109	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	20.7006	11.3057
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET2Gv21151200.27	9.77778	5.77778	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	3.50318	2.07006
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET6Gv20680600.1	17.541	8.19672	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	17.0382	7.96178
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET4Gv20241200.1	23.9024	13.6585	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	7.80255	4.4586
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET7Gv20232300.20	11.6637	6.14828	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	20.5414	10.828
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET7Gv20898500.11	17.5103	10.1231	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	20.3822	11.7834
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET6Gv20744100.2	21.8798	10.9399	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	22.6115	11.3057
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET3Gv20933200.3	22.158	11.5607	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	18.3121	9.55414
AET3Gv20768600	aegilops_tauschii	AET7Gv20607200.2	21.3873	10.0193	aegilops_tauschii	AET3Gv20768600.10	17.6752	8.28025
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Orthologs

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